心理咨询师证书的发放是由多个部门负责的，这些部门主要包括：
1、人力资源和社会保障部（Ministry of Human Resources and Social Security）：作为国家行政机关，人力资源和社会保障部负责管理全国的人力资源和社会保障工作，包括职业资格认证、职业培训等，心理咨询师证书的发放也是由该部门负责的。
2、教育部（Ministry of Education）：教育部主要负责教育政策的制定和实施，包括职业资格认证，心理咨询师证书的发放也是由该部门负责的。
3、卫生健康委员会（Ministry of Health）：卫生健康委员会主要负责公共卫生和医疗服务的管理，包括职业健康和心理健康的保障，心理咨询师证书的发放也是由该部门负责的。
4、民政局（Ministry of Civil Affairs）：民政局主要负责社会事务的管理，包括社会组织的管理和社区服务，心理咨询师证书的发放也是由该部门负责的。
5、工商行政管理局（Industrial and Commercial Administration）：工商行政管理局主要负责企业注册和市场监管，包括心理咨询机构的设立和管理，心理咨询师证书的发放也是由该部门负责的。
6、税务局（Taxation Administration）：税务局主要负责税收的征收和管理，包括对心理咨询机构的收入进行监管，心理咨询师证书的发放也是由该部门负责的。
7、地方各级人民政府及其相关部门：地方政府及其相关部门负责本地区的人事、教育和卫生等方面的管理工作，包括心理咨询师证书的发放。
8、行业协会或专业组织：如中国心理卫生协会等，这些协会或专业组织负责心理咨询师的专业培训、考核和认证工作，以及心理咨询师证书的发放。
9、其他相关政府部门：如公安部门、司法部门等，这些部门在特定情况下会参与心理咨询师证书的发放工作。
心理咨询师证书的发放是由人力资源和社会保障部、教育部、卫生健康委员会、民政局、工商行政管理局、税务局、地方政府及其相关部门、行业协会或专业组织以及其他相关政府部门共同负责的，这些部门在各自的职责范围内，通过不同的途径和程序，确保心理咨询师证书的合法性、有效性和权威性。
